Ten slotte hebben we een reeks analyses puma fenty creeper uitgevoerd om de demografische geschiedenis van poema's te onderzoeken.We hebben neutraliteitstests uitgevoerd (Tajima's D, Fu & Li 'D * en F *, Fu's F's) met DnaSP, evenals een analyse van de verkeerde combinatie (Rogers en Harpending, 1992; Schneider and Excoffier, 1999) met Arlequin.

De BSP-analyses werden alleen uitgevoerd voor sets (i) en (ii), puma badslippers omdat hun grotere steekproefomvang robuustere demografische gevolgtrekkingen mogelijk maakte De MCMC-parameters waren hetzelfde als in de eerste set Beast-analyses.

Extra sequenties puma for baby van hetzelfde fragment werden verkregen voor twee P. yagouaroundi-individuen.

De puma-dataset bevatte 33 variabele locaties (32 overgangen en één transversie), waarvan er 25 fylogenetisch informatief waren (tabel 1). In totaal waren er 28 haplotypes, waarvan er 22 in Zuid-Amerika voorkwamen puma babys (H01 elke H22), een daarvan (H09) wordt gedeeld met Midden-Amerika (Figuur 2A).

Mediaan-verbindende netwerken gebaseerd op puma ND5 haplotypes. puma california sneakers Het gebied van elke cirkel is evenredig met de haplotype frequentie. De relatieve frequentie van populaties in elk haplotype wordt aangegeven door het aandeel van verschillende kleuren (gecodeerd zoals in Figuur 1).

A) Analyse van de volledige dataset (669 bp) De pijl geeft het punt aan waar de outgroep P. yagouaroundi is verbonden B) Analyse van een subset van de nucleotideplaatsen die overlappen met de Miracinonyx trumani-sequentie (286 bp). geef de punten aan waar de outgroup-taxa zich bij het netwerk aansluiten: P. yagouaroundi (in grijs; 32 mutatiestappen vanaf het verbindingspunt) en M. trumani (in zwart; 19 stappen vanaf het verbindingspunt).